好氣性發酵過程中泡沫的形成是有一定規律的。泡沫的多少一方面與通風、攪拌的劇烈程度有關，攪拌所引起的泡沫比通氣來得大；另一方面與培養基所用原材料的性質有關，蛋白質原料如蛋白胨、玉米漿、黃豆粉、酵母粉等是主要的起泡因素。通常，培養基的配方含蛋白質多，濃度高，粘度大，容易起泡，且泡沫多而持久穩定。膠體物質多、粘度大的培養基更容易產生泡沫，如糖蜜原料與石油烴類原料，發泡能力特別強，泡沫多而持久穩定。多糖的水解不完全，糊精含量多，也容易引起泡沫的產生。培養基的滅菌方法和操作條件均會影響培養基成分的變化而影響發酵時泡沫的產生。因此可見，發酵過程中泡沫形成的穩定性與培養基的性質有著密切的關系。

在發酵過程中培養液的性質，因微生物的代謝活動而處于運動變化中，也會影響泡沫的形成和消長。例如，霉菌在發酵過程中的代謝活動所引起的培養液液體表面性質變化直接影響泡沫的消長。發酵初期，由于培養基濃度發，粘度高，營養料豐富，因而泡沫的穩定性與高的表面黏度和低的表面張力有關。隨著發酵進行，表面黏度下降，表面張力上升，泡沫壽命逐漸縮短。另外，菌的繁殖，尤其是細菌本身具有穩定泡沫的作用，在發酵最旺盛時泡沫形成比較多，在發酵后期菌體自溶導致發酵液中可溶性蛋白質增加，又有利于泡沫的產生。此外，發酵過程中污染雜菌而使發酵液黏度增加，也會產生大量泡沫。

微生物工業上消除泡沫常用的方法有兩種：化學消泡和機械消泡。